Ogni Villaggio Ninja ha una squadra di Ninja scelti, l'elite delle forze del villaggio, la Squadra Speciale (ANBU). Gli Anbu si suddividono in: Squadra Assassina, Ninja Inseguitori e Squadra Medica:

Squadra assassina: Squadra che si occupa delle missioni di omicidio e di assassini in generale.

Ninja inseguitori: Sono gli ANBU addetti a rintracciare i ninja fuggiti dal villaggio e ucciderli, eliminandone i cadaveri e occultando ogni prova della loro esistenza passata, per proteggere le eventuali abilità innate in possesso dei traditori e gli altri segreti che conoscono.

Squadra medica: Squadra composta da Ninja preparatissimi nella medicina, che conoscono molte tecniche per curare i feriti e che vengono solitamente utilizzati come supporto nelle missioni. ma che di solito rimangano nelle retrovie non significa che non sappiano uccidere.

Maschera Anbu

Il gruppo speciale dei Ninja, gli ANBU, usa le maschere per nascondere la propria identità. Ogni membro della squadra ANBU possiede un stile di maschera diversa ed ogni maschera sembra essere basata su animali. Ogni maschera che rappresenta un animale diverso rispecchia il carattere del ninja che la indossa.